MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum F str. 230613 plasmid pCBF

Total Repeats: 532

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017298	CTT	2	6	17	22	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017298	TATTT	2	10	38	47	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017298	A	6	6	92	97	100 %	0 %	0 %	0 %	384463963
4	NC_017298	GA	3	6	120	125	50 %	0 %	50 %	0 %	384463963
5	NC_017298	TGG	3	9	138	146	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463963
6	NC_017298	GCT	2	6	181	186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384463963
7	NC_017298	GGT	2	6	187	192	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463963
8	NC_017298	TGG	2	6	201	206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463963
9	NC_017298	ATG	2	6	215	220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384463963
10	NC_017298	A	7	7	228	234	100 %	0 %	0 %	0 %	384463963
11	NC_017298	TA	3	6	243	248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017298	AGG	2	6	254	259	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017298	TGG	2	6	309	314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463964
14	NC_017298	GGT	2	6	319	324	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463964
15	NC_017298	GCT	2	6	349	354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384463964
16	NC_017298	TGG	2	6	366	371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463964
17	NC_017298	TGT	2	6	372	377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384463964
18	NC_017298	AGC	2	6	391	396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384463964
19	NC_017298	TGG	2	6	408	413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463964
20	NC_017298	TGG	2	6	420	425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463964
21	NC_017298	ATG	2	6	451	456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384463964
22	NC_017298	AAT	2	6	470	475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017298	ATTT	2	8	486	493	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017298	TAAA	2	8	507	514	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017298	T	6	6	522	527	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017298	TA	3	6	545	550	50 %	50 %	0 %	0 %	384463965
27	NC_017298	TCT	2	6	590	595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463965
28	NC_017298	CTA	2	6	619	624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384463965
29	NC_017298	T	7	7	655	661	0 %	100 %	0 %	0 %	384463965
30	NC_017298	ATT	2	6	668	673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463965
31	NC_017298	ATTT	2	8	679	686	25 %	75 %	0 %	0 %	384463965
32	NC_017298	A	8	8	689	696	100 %	0 %	0 %	0 %	384463965
33	NC_017298	CTAT	2	8	756	763	25 %	50 %	0 %	25 %	384463965
34	NC_017298	TTA	2	6	784	789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463965
35	NC_017298	TAAC	2	8	929	936	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
36	NC_017298	T	6	6	942	947	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017298	TAA	2	6	957	962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017298	ATG	2	6	971	976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017298	A	7	7	1040	1046	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_017298	GTA	2	6	1047	1052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_017298	T	6	6	1066	1071	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_017298	CTAT	2	8	1076	1083	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
43	NC_017298	TATC	2	8	1093	1100	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
44	NC_017298	TATGA	2	10	1110	1119	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
45	NC_017298	TATTCA	2	12	1163	1174	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	384463966
46	NC_017298	CAA	2	6	1210	1215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384463966
47	NC_017298	CT	3	6	1224	1229	0 %	50 %	0 %	50 %	384463966
48	NC_017298	CT	3	6	1247	1252	0 %	50 %	0 %	50 %	384463966
49	NC_017298	TTGT	2	8	1283	1290	0 %	75 %	25 %	0 %	384463966
50	NC_017298	AT	3	6	1291	1296	50 %	50 %	0 %	0 %	384463966
51	NC_017298	CAC	2	6	1312	1317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384463966
52	NC_017298	AC	3	6	1343	1348	50 %	0 %	0 %	50 %	384463966
53	NC_017298	A	6	6	1358	1363	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017298	ATA	2	6	1409	1414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017298	TA	3	6	1413	1418	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017298	AAT	2	6	1434	1439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017298	A	6	6	1456	1461	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017298	TTATAA	2	12	1485	1496	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017298	T	6	6	1503	1508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017298	A	7	7	1510	1516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_017298	A	6	6	1550	1555	100 %	0 %	0 %	0 %	384463967
62	NC_017298	AGA	2	6	1572	1577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384463967
63	NC_017298	TGG	2	6	1584	1589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463967
64	NC_017298	TATAA	2	10	1675	1684	60 %	40 %	0 %	0 %	384463967
65	NC_017298	TAAT	2	8	1695	1702	50 %	50 %	0 %	0 %	384463967
66	NC_017298	AGG	2	6	1707	1712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_017298	A	6	6	1714	1719	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017298	TTA	2	6	1736	1741	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463968
69	NC_017298	TGA	2	6	1747	1752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384463968
70	NC_017298	TTA	2	6	1760	1765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463968
71	NC_017298	GTG	2	6	1806	1811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384463968
72	NC_017298	TGC	2	6	1819	1824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384463968
73	NC_017298	GTT	3	9	1841	1849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384463968
74	NC_017298	ACA	2	6	1856	1861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384463968
75	NC_017298	ATA	2	6	1894	1899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463968
76	NC_017298	A	6	6	1922	1927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017298	ATT	2	6	1930	1935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017298	T	7	7	1934	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_017298	TAT	2	6	1979	1984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463969
80	NC_017298	TA	4	8	1986	1993	50 %	50 %	0 %	0 %	384463969
81	NC_017298	TA	4	8	2004	2011	50 %	50 %	0 %	0 %	384463969
82	NC_017298	AAT	2	6	2031	2036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463969
83	NC_017298	TAA	3	9	2088	2096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463969
84	NC_017298	CAC	2	6	2105	2110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384463969
85	NC_017298	TA	3	6	2139	2144	50 %	50 %	0 %	0 %	384463969
86	NC_017298	ATA	2	6	2191	2196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384463969
87	NC_017298	T	7	7	2218	2224	0 %	100 %	0 %	0 %	384463969
88	NC_017298	ATAA	2	8	2243	2250	75 %	25 %	0 %	0 %	384463969
89	NC_017298	A	7	7	2266	2272	100 %	0 %	0 %	0 %	384463969
90	NC_017298	TA	3	6	2291	2296	50 %	50 %	0 %	0 %	384463969
91	NC_017298	TAT	2	6	2300	2305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463969
92	NC_017298	AT	3	6	2304	2309	50 %	50 %	0 %	0 %	384463969
93	NC_017298	TCA	2	6	2323	2328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384463969
94	NC_017298	TTC	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384463969
95	NC_017298	TAT	2	6	2369	2374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463969
96	NC_017298	TAAT	2	8	2381	2388	50 %	50 %	0 %	0 %	384463969
97	NC_017298	AAAT	2	8	2396	2403	75 %	25 %	0 %	0 %	384463970
98	NC_017298	TTA	2	6	2415	2420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384463970
99	NC_017298	CCT	2	6	2585	2590	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_017298	ATT	2	6	2593	2598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017298	TA	3	6	2620	2625	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017298	TA	5	10	2628	2637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017298	TAA	2	6	2645	2650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017298	TA	3	6	2651	2656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017298	ATTTTT	2	12	2824	2835	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_017298	TTA	2	6	2859	2864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017298	ATT	2	6	2869	2874	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017298	ATA	2	6	2875	2880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_017298	AGG	2	6	2891	2896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_017298	A	6	6	2969	2974	100 %	0 %	0 %	0 %	384463971
111	NC_017298	A	7	7	3072	3078	100 %	0 %	0 %	0 %	384463971
112	NC_017298	AT	3	6	3096	3101	50 %	50 %	0 %	0 %	384463971
113	NC_017298	ATTAA	2	10	3129	3138	60 %	40 %	0 %	0 %	384463971
114	NC_017298	AT	3	6	3185	3190	50 %	50 %	0 %	0 %	384463971
115	NC_017298	ATGA	2	8	3195	3202	50 %	25 %	25 %	0 %	384463971
116	NC_017298	ACA	2	6	3248	3253	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384463971
117	NC_017298	AT	3	6	3262	3267	50 %	50 %	0 %	0 %	384463971
118	NC_017298	GCT	2	6	3276	3281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384463971
119	NC_017298	GGCT	2	8	3353	3360	0 %	25 %	50 %	25 %	384463971
120	NC_017298	GAT	2	6	3438	3443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384463971
121	NC_017298	ATTA	2	8	3475	3482	50 %	50 %	0 %	0 %	384463971
122	NC_017298	GGGT	2	8	3490	3497	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
123	NC_017298	AATT	2	8	3506	3513	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_017298	AAGG	2	8	3526	3533	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017298	TTAC	2	8	3642	3649	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
126	NC_017298	TC	3	6	3656	3661	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_017298	AT	3	6	3866	3871	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_017298	TTTA	2	8	3888	3895	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017298	TAG	2	6	4008	4013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384463972
130	NC_017298	ATAAA	2	10	4071	4080	80 %	20 %	0 %	0 %	384463972
131	NC_017298	TAC	2	6	4162	4167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_017298	TAT	2	6	4192	4197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017298	TTA	2	6	4204	4209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_017298	TAT	2	6	4214	4219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_017298	TAT	2	6	4234	4239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017298	TAAA	2	8	4257	4264	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_017298	T	6	6	4305	4310	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_017298	ATTA	2	8	4322	4329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_017298	TATT	2	8	4345	4352	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017298	TAT	2	6	4355	4360	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017298	TATT	2	8	4368	4375	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017298	TAT	2	6	4378	4383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017298	ATT	2	6	4394	4399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017298	ACTT	2	8	4448	4455	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_017298	TTA	2	6	4465	4470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_017298	TA	3	6	4469	4474	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_017298	TAC	2	6	4480	4485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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